Во первых: если дом перестраивался, то проект заказывать заново, однозначно; Во вторых: из вашего описания наврядли кто что поймет по какой причине проектировшики заставляют Вас убирать ввод в цоколь, нужно смотреть по месту (возможно высоты не проходят либо другие ограничения) либо обратиться к другому проектировщику. Вам необходимо заказать новый проет либо при наличии откорректировать старый проект в связи с реконструкцией дома. В общем ни чего страшного в Вашей ситуации нет, это норма. Удачи Вам.